المرحلة الثانية :

تقوم فيها مجموعه من البكتريا تسمى عادة
Syntrophic bacteria
بهدم الحماض الدهنيه طويلة السلسله وحامض البروبيونيك والكحولات المختلفه وبعض الاحماض الامينيه والمركبات الاروماتيه الى المواد الاوليه لانتاج غاز الميثان وهى الهيدروجين والخلات والفورمات ونظرا لان هناك كثير من البكتريا يمكنها ان تهدم هذه المواد دون ان تكون نواتج الهدم هى المواد الاوليه لانتاج غاز الميثان فان البكتريا التى تقوم بتفاعلات المرحله الثانيه تسمى Syntrophic metabolizers

المرحلة الثالثة :

تقوم بها مجموعات كبيره ومتنوعه من بكتريا الميثان حيث توجد مجموعه تستخدم الهيدروجين والفورمات الناتجين من المرحله الثانيه لاختزال ثانى اكسيد الكربون الى ميثان وتسمى هذه المجموعه hydrogenotrophic methanogens وتوجد مجموعه اخرى تمثل الخلات الى ميثان وثانى اكسيد الكربون وتسمى هذه المجموعة
acetotrophic methanogens