على الرغم أن معظم البوابات والمنشآت المائية تكون مغلقة، ولكنها تقع تحت ضغط بسبب الارتفاع الجغرافي، وتحرر كمية لا بأس بها من الماء التي لا تستعمل من أجل الري وإنما تتسرب في التربة أو تذهب في الوديان بدون فائدة.
يحدث التسرب أحياناً لأن الأبواب لا تسكر بإحكام أو أن الأبواب ليست مسدودة على إطاراتها، يمكن إزالة هذه الضياعات على القسم الحكومي من الشبكة بتنفيذ المنشآت المائية بشكل جيد وصيانتها بصورة مستمرة.

يمكن التغلب على المياه الضائعة من خطوط الري والمساطب بوضع برنامج سقاية يعتمد على نوع المحصول والتربة والظروف المناخية للمنطقة. كما أعطت الأبحاث في مضمار الزراعة لمنطقة رستوف ، ومنطقة كرسندرو ستافربولسكي (الاتحاد السوفييتي) أن الماء الزائد في نهاية الأقنية والمساطب وأثلام الري قد تصل من 15-20% من الماء الكلي وخصوصاً أن هناك ضياعات كثيرة تلاحظ عند استعمال الري بالرذاذ حيث أنه عندما تتوقف أو تتعطل الآلة، فعندئذٍ تذهب جميع الماء القادمة في القناة بدون فائدة.
بينت المراقبة المعمولة بواسطة المعهد السابق الذكر أنه في بعض الأقنية عندما لايعطي الري لـ24 ساعة ، يبقى من الماء 250-350 متر مكعب كل يوم.

لكي نتحاشى هذه الضياعات من الضروري أن تكون السقاية ليلاً نهاراً أو أنه يجب وضع الأبواب من القناة الدائمة إلى القناة المؤقتة في الأسفل.
عندما تنبت الأعشاب أو تتجمع الترب في الأقنية الدائمة فإن الأقنية تعمل على أعلى درجة وأحياناً يلاحظ الماء ينسكب من أطراف القناة، في هذه الأحوال يكثر التسرب من الأطراف العلوية ذات النفاذية الكبيرة من جوانب القناة.
من أجل تحاشي هذه الأشياء يجب على العاملين في هذا المجال أن ينظموا أعمالهم على أقنية الري بطريقتين:

أ‌- العمل على إزالة الأعشاب ميكانيكياً ، كيميائياً، وبيولوجياً...).
ب‌- تنظيف القناة من التربة المتجمعة بواسطة الآلة، عندما تنبت الأعشاب على الوجه الداخلي والميل الخارجي للقناة فيجب إزالتها، بعمل ذلك تتفكك التربة أحياناً، ولذلك تعمل بآلات ذات أقراص خصوصية لذلك.

من الطرق الكيميائية لعزل الأعشاب على شبكات الري يستعمل الرش بالمبيدات النباتية،
(سولفامات الأمونيا، آترازين ومواد أخرى) وكذلك بواسطة بقايا الصناعة الكيميائية المحلية وكذلك المواد النفطية.

من أجل تنظيف الأقنية من الترسبات تستعمل حفارة ذات معزقة واحدة أو حفارة مع مجرفة بسعة 0.25 -1 م مكعب. تستعمل هذه الحفارات من أجل بقايا بسماكة لاتقل عن 0.35-0.5 م ، يمكن استعمال كريدر ثقيل وكذلك ماكينة خاصة لتعزيل الأقنية مع أجهزة معلقة ومثبتة والتي بها تنظف جوانب القناة الداخلية من الترسبات والنباتات، تنظف الآلة أقنية بعمق 0.8-1.5 م وعرض قعر 0.3-1.5 م وميل جوانب 1:1، 1:1.5 وهي تحمل على تراكتور وإنتاجها يصل إلى 45 متر مكعب في الساعة.
يمكن استعمال حفارات ذات عدة مفارق موضوعة بالعرض والتي تنظف بوقت واحد قعر وجوانب القناة وإنتاجها 100 متر مكعب في الساعة.

ملاحظة :
يمكن حساب الضياعات بالتبخر من المعادلة التالية :

م3/ثا ( E – 0.016 he ( a + M
حيث :
h: عمق الماء في القناة بـ م.
e : عمق الطبقة المائية المتبخرة بـ م/ يوم
a : علاقة عرض قاع القناة إلى عمق الماء b/h
M: الميول الجانبية